Байер Леверкузен считается главным клубом, так как они регулярно принимают участие в соревновании в Лиге Чемпионов, и даже выходили в финал в 2001-2002 сезоне, и только проиграли Риал Мадриду. Их тренер в то время Клаус Топпцлер был вдохновляющей фигурой в их подъеме на вершину Европейского футбольного клуба

5 июня 2009 года на тренерский мостик "фармацевтов" взошел Юпп Хайнкес. Под его руководством Байер провел серию из двадцати четырех беспроигрышных матчей в Бундеслиге и стал обладателем неофициального титула зимнего чемпиона Германии 2009/10.